Hoe om die data te lees en te interpreteer
Waar data vir 'n land vanaf meer as een bron beskikbaar is, is die verstekbron wat gebruik word die een met die hoogste aantal reekse in die afgelope twee weke.
Data vir die mees onlangse verslagdoeningsweek is uitgesluit, aangesien dit onvolledig kan wees.
Kategorieë wat gebruik word vir die opeenvolging van volume is gebaseer op die steekproefseleksie riglyne verskaf in ECDC se tegniese leiding vir volgordebepaling van SARS-CoV-2 en sy leiding vir verteenwoordigende en geteikende genomiese SARS-CoV-2-monitering:
- ≥500 of ≥10% van gevalle: 500 of meer, of ten minste 10% van alle monsters in volgorde, per week; indien steekproewe lukraak gekies word, is dit moontlik om tendense te volg en die verspreiding van variante te skat. Hoër getalle sal die akkuraatheid verhoog en die opsporing van variante moontlik maak wat verantwoordelik is vir 'n kleiner deel van sirkulerende virusse.
- 60-499: Bo 60 maar minder as 500 monsters per week. As monsters ewekansig geselekteer word, is dit moontlik om 'n variant op te spoor wat meer as 2.5% van alle sirkulerende variante uitmaak en om tendense te volg, maar om variante verspreiding te skat sal onakkuraat wees.
- <60: Onder 60 geselekteerde monsters per week, sal 'n spesifieke variant minstens 5% van alle sirkulerende virusse moet uitmaak om opgespoor te word, indien monsterneming op 'n ewekansige en verteenwoordigende wyse uitgevoer word. Dit beteken dat die stelsel 'n swak vermoë sal hê om sirkulerende variante van kommer op te spoor voordat hulle 'n impak op die algehele epidemiologiese situasie het.
Hoe om die dashboard te gebruik:
Kies die weeknommer om kaarte te filter en die variantverspreidingsgrafiek.
Kies die land om beide grafieke te filter.
Die hele kontroleskerm kan gefiltreer word om slegs data te wys wanneer volgordebepalingsvolumes bo dié was wat deur ECDC aanbeveel is (>=500 reekse of >=10% van gevalle in 'n spesifieke week volgorde) deur op "konfigureer bronne handmatig" te klik en die "bron te gebruik" ” filter (regs bo) om bronne te wissel.
Beperkings:
Aangesien nie alle gegenereerde reekse gerapporteer word nie, kan onderskattings van die volgordebepalingaktiwiteite in sommige lande voorkom. Sien asseblief die landoorsigverslag vir bykomende beperkings.
Die proporsie variante is slegs betroubaar wanneer volgordebepalingskapasiteit voldoende is (≥500 of ≥10% van totale monsters). Selfs dan moet skattings met omsigtigheid hanteer word, aangesien dit bevooroordeeld kan wees as die virusse nie verteenwoordigend is van alle gevalle in die land nie. Vir TESSy-data is geen proporsie variante beraam waar daar geen betroubare noemer beskikbaar is nie.
Agtergrondinligting
Sedert die ontdekking van SARS-CoV-2 is drie variante van kommer, wat die eerste keer in die Verenigde Koninkryk (B.1.1.7), Suid-Afrika (B.1.351) en Brasilië (P.1) geïdentifiseer is, geassosieer met hoër oordraagbaarheid en erns van siekte, met potensiële implikasies vir verworwe immuniteit of die doeltreffendheid van huidige entstowwe. Daarbenewens is SARS-CoV-2-afstammelinge B.1.617.1, B.1.617.2 en B.1.617.3, wat vir die eerste keer in Desember 2020 in Indië aangemeld is, toenemend in ander lande opgespoor.
