Den 8. februar registrerede Litauens justitsministerium en ny religiøs struktur – et eksarkat, som vil blive underordnet patriarkatet i Konstantinopel. Således vil to ortodokse kirker blive officielt anerkendt i landet: en tilhørende det økumeniske patriarkat og det eksisterende bispedømme i Moskva-patriarkatet i Litauen.
Det nye religiøse samfund har ti præster og planlægger at danne styrende organer i den nærmeste fremtid. Det ledes nu af den estiske præst Justinus Kiviloo, som holdt sin første gudstjeneste i Litauen i begyndelsen af januar 2024. De resterende præster tjente tidligere i den russisk-ortodokse kirke (ROC): seks i Litauen, to i Hviderusland og én i Rusland .
Patriark Kirills støtte til Den Russiske Føderations krig mod Ukraine er årsagen til oprettelsen af det nye eksarkat. Denne holdning førte til en konflikt mellem ni gejstlige og ledelsen af den russisk-ortodokse kirke. I 2022 fjernede Vilnius og Litauens Metropolit Innocent fem af dem fra ministeriet, og patriark Bartholomew genindsatte dem og accepterede dem under hans jurisdiktion. I marts 2023 besøgte patriark Bartholomew Vilnius og underskrev en aftale med den litauiske regering om at etablere eksarkatet for patriarkatet i Konstantinopel i landet.
ROC's bispedømme i Litauen reagerede roligt på den nye kirkes udseende. Metropolit Innocent sagde, at det nye religiøse samfund skal accepteres som en "virkelighed i vor tid".
Lokale medier har bemærket, at siden starten på Ruslands fuldskala invasion af Ukraine, har ROC bispedømmet i Litauen søgt større uafhængighed fra Moskva-patriarkatet.
Der er 105,000 ortodokse troende i Litauen, hvoraf de fleste er russisktalende. Ortodokse kristne betragtes som et af de ni traditionelle religiøse samfund i landet.
