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Domenica, gennaio 29, 2023

I ricercatori identificano i geni associati a un aumento significativo del rischio di COVID-19

DISCLAIMER: Le informazioni e le opinioni riprodotte negli articoli sono quelle di chi le dichiara ed è sotto la propria responsabilità. La pubblicazione su The European Times non significa automaticamente avallo del punto di vista, ma il diritto di esprimerlo.

Avere varianti di rischio genetico nel gene ABO potrebbe aumentare significativamente le possibilità di sviluppo COVID-19e altri geni possono anche aumentare il rischio di COVID-19, secondo una ricerca presentata alla Conferenza internazionale ATS 2021.

Gran parte di COVID-19 rimane un mistero medico, compreso se alcuni geni mettono gli individui a maggior rischio di contrarre il SARS-CoV-2 virus, che causa il COVID-19. Ana Hernandez Cordero, PhD, borsista post-dottorato presso il Center for Heart Lung Innovation, University of British Columbia, e colleghi hanno utilizzato la genomica integrativa combinata con la proteomica per identificare questi geni.

La ricerca genomica identifica geni specifici che possono svolgere un ruolo in processi biologici come lo sviluppo di malattie, mentre la proteomica fa lo stesso per le proteine. I ricercatori possono ottenere un quadro più completo dei processi patologici integrando strumenti per indagare su entrambi.

"DNA è una molecola grande e complessa e quindi, le associazioni genetiche da sole non possono individuare il gene esatto responsabile del COVID-19", ha affermato il dottor Hernandez. "Tuttavia, combinando le informazioni genetiche di COVID-19 con l'espressione genica e i set di dati proteomici, possiamo capire quali geni stanno guidando la relazione con COVID-19".

I ricercatori hanno combinato le informazioni genetiche con un esame dell'espressione genica polmonare per identificare le varianti genetiche che controllavano l'espressione genica nel polmone responsabili di COVID-19. I ricercatori hanno identificato marcatori di geni specifici che condividono i loro effetti sull'espressione genica e sui livelli proteici con suscettibilità COVID-19. Per l'analisi, hanno utilizzato la bioinformatica per integrare: (1) un set di dati genomici ottenuto da pazienti infettati da SARS-CoV-2 e individui non infetti (controlli); (2) set di dati sull'espressione genica del polmone e del tessuto sanguigno da popolazioni cliniche (non COVID-19); e (3) un set di dati sul proteoma ottenuto da donatori di sangue (non COVID-19).

In questo modo, hanno scoperto che diversi geni responsabili della risposta del sistema immunitario a COVID-19 sono coinvolti anche nella suscettibilità al COVID-19. Ciò che hanno scoperto è stato supportato dai risultati di ricerche precedenti.

Alla ricerca di geni candidati nelle proteine ​​del sangue, sono stati in grado di fare un ulteriore passo avanti nel collegare gli effetti dei geni alla suscettibilità al COVID-19. La proteomica del sangue può anche aiutare a identificare i marcatori nel sangue che possono essere facilmente misurati per indicare lo stato della malattia e, potenzialmente, per monitorare la malattia.

"Sfruttando il potere delle informazioni genomiche, abbiamo identificato i geni correlati al COVID-19", ha affermato il dottor Hernandez. “In particolare, abbiamo scoperto che il gene ABO è un fattore di rischio significativo per COVID-19. Di particolare rilievo è stata la relazione tra il gruppo sanguigno ABO e il rischio COVID-19. Abbiamo dimostrato che la relazione non è solo un'associazione, ma è causale".

Oltre al gene ABO, il dottor Hernandez e colleghi hanno scoperto che le persone portatrici di determinate varianti genetiche per SLC6A20, ERMP1, FCER1G e CA11 hanno un rischio significativamente più elevato di contrarre COVID-19. “Questi individui dovrebbero usare estrema cautela durante la pandemia. Questi geni possono anche rivelarsi buoni marcatori di malattie e potenziali bersagli farmacologici”.

Molti dei geni identificati nell'analisi dei ricercatori sono già stati collegati a malattie respiratorie. Ad esempio, ERMP1 è stato collegato all'asma. CA11 può anche aumentare il rischio di COVID-19 per le persone con diabete.

Le associazioni genetiche per COVID-19 e l'espressione genica e proteica sono state combinate utilizzando la genomica integrativa (IG). IG mira a identificare i meccanismi (ad esempio: livelli di espressione genica) che collegano gli effetti del codice genetico a una malattia complessa. Questi metodi, sebbene complessi, sono anche veloci e i loro risultati possono aiutare i ricercatori a dare la priorità ai geni candidati per i test in vitro (in laboratorio) e in vivo (negli organismi viventi).

Il dottor Hernandez ha aggiunto: "La nostra ricerca è progredita dal momento in cui abbiamo condotto questa analisi per la prima volta. Ora abbiamo identificato candidati ancora più interessanti per COVID-19 come IL10RB, IFNAR2 e OAS1. Questi geni sono stati collegati a COVID-19 severo. Il loro ruolo nella risposta immunitaria alle infezioni virali e le crescenti prove suggeriscono che questi candidati e il loro ruolo nel COVID-19 dovrebbero essere ulteriormente studiati”.

Riferimento: "Integrative Genomic Analysis Highlights Potential Genetic Risk Factors for Covid-19" di AI Hernandez Cordero, X. Li1, S. Milne, C. Yang, Y. Bossé, P. Joubert, W. Timens, M. Van den Berge , D. Nickle, K. Hao e DD Sin, 3 maggio 2021, Conferenza Internazionale ATS 2021.
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