"UNRWA fortsetter å levere bistand og tjenester til lokalsamfunnene vi betjener", sa byrået et innlegg på den sosiale medieplattformen X.
"Våre klinikker over den okkuperte Vestbredden inkludert Øst-Jerusalem er åpne mens den humanitære operasjonen i Gaza fortsetter."
Ingen offisielle ord
I oktober i fjor vedtok det israelske parlamentet, kjent som Knesset, to lover som ba om å avslutte UNRWAs operasjoner på dets territorium og forbyr israelske myndigheter å ha kontakt med byrået.
Israel beordret UNRWA til å forlate alle lokaler i det okkuperte Øst-Jerusalem og stanse operasjoner i dem innen 30. januar i år.
I en separat innlegg den X sa UNRWA at de ikke hadde mottatt noen offisiell kommunikasjon om hvordan regningene vil bli implementert.
Frykt for påvirkning
Uttaler til The Guardian, UNRWAs kommunikasjonsdirektør Juliette Touma sa hovedkvarteret i Øst-Jerusalem "er fortsatt der" og flagget vaier fortsatt.
"Vi har ingen planer om å stenge vår virksomhet," sa hun. "Men vi er i mørket."
Siden 1950 har UNRWA bistått palestinske flyktninger i Jordan, Libanon, Syria, Gaza og Vestbredden, inkludert Øst-Jerusalem.
Forbudet truer livreddende bistand, utdanning og helsetjenester for millioner i OPT, og FN har gjentatte ganger advart om konsekvensene.
Palestinere i Gaza er også bekymret, inkludert Iman Hillis, som for tiden bor på en UNRWA-skole med familien sin.
"Vi vil ikke ha noe å spise eller drikke, og dette vil påvirke oss sterkt," hun fortalte FNs nyheter på onsdag. "Hele folket skal bli ødelagt og vil ikke ha mat, vann eller mel."