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新闻研究人员确定了与 COVID-19 风险显着增加相关的基因

研究人员确定了与 COVID-19 风险显着增加相关的基因

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在 ABO 基因中存在遗传风险变异可能会显着增加发展的机会 Covid-19根据 ATS 19 国际会议上提出的研究,其他基因也可能增加 COVID-2021 的风险。

关于 COVID-19 的许多事情仍然是一个医学谜团,包括某些基因是否会使个体面临更大的感染风险 SARS-COV-2 病毒,导致 COVID-19。 不列颠哥伦比亚大学心肺创新中心博士后研究员 Ana Hernandez Cordero 博士及其同事使用整合基因组学和蛋白质组学来识别这些基因。

基因组研究确定了可能在疾病发展等生物过程中发挥作用的特定基因,而蛋白质组学对蛋白质的作用相同。 通过整合工具来调查两者,研究人员可以更全面地了解疾病过程。

的DNA 是一个大而复杂的分子,因此,仅靠遗传关联无法确定导致 COVID-19 的确切基因,”Hernandez 博士说。 “然而,通过将 COVID-19 遗传信息与基因表达和蛋白质组数据集相结合,我们可以确定哪些基因正在推动与 COVID-19 的关系。”

研究人员将遗传信息与肺基因表达检查相结合,以确定控制肺中导致 COVID-19 基因表达的基因变异。 研究人员确定了特定基因的标记,这些标记与 COVID-19 易感性具有相同的基因表达和蛋白质水平影响。 为了进行分析,他们使用生物信息学来整合:(1)从感染 SARS-CoV-2 的患者和未感染个体(对照)获得的基因组数据集; (2) 来自临床人群(非 COVID-19)的肺和血液组织基因表达数据集; (3) 从献血者(非 COVID-19)获得的蛋白质组数据集。

通过这样做,他们发现负责免疫系统对 COVID-19 反应的几个基因也与 COVID-19 易感性有关。 他们的发现得到了先前研究结果的支持。

在血液蛋白中寻找候选基因,他们能够更进一步将基因的影响与对 COVID-19 的易感性联系起来。 血液蛋白质组学还可以帮助识别血液中的标志物,这些标志物可以很容易地测量以指示疾病状态,并有可能监测疾病。

“通过利用基因组信息的力量,我们确定了与 COVID-19 相关的基因,”Hernandez 博士说。 “特别是,我们发现 ABO 基因是 COVID-19 的重要风险因素。 特别值得注意的是 ABO 血型与 COVID-19 风险之间的关系。 我们证明了这种关系不仅仅是一种关联,而且是因果关系。”

除了 ABO 基因,Hernandez 博士及其同事发现,携带某些 SLC6A20、ERMP1、FCER1G 和 CA11 基因变异的人感染 COVID-19 的风险明显更高。 “这些人在大流行期间应格外小心。 这些基因也可能被证明是疾病的良好标志物以及潜在的药物靶点。”

研究人员分析中发现的几个基因已经与呼吸系统疾病有关。 例如,ERMP1 与哮喘有关。 CA11 还可能增加糖尿病患者的 COVID-19 风险。

使用整合基因组学 (IG) 将 COVID-19 与基因和蛋白质表达的遗传关联结合起来。 IG 旨在确定将遗传密码的影响与复杂疾病联系起来的机制(例如:基因表达水平)。 这些方法虽然复杂,但速度也很快,它们的结果可以帮助研究人员优先考虑候选基因,以进行体外(实验室)和体内(活生物体)测试。

Hernandez 博士补充说:“自我们首次进行这项分析以来,我们的研究已经取得了进展。 我们现在已经确定了更有趣的 COVID-19 候选者,例如 IL10RB、IFNAR2 和 OAS1。 这些基因与严重的 COVID-19 相关。 它们在对病毒感染的免疫反应中的作用和越来越多的证据表明,应进一步研究这些候选物及其在 COVID-19 中的作用。”

参考:“综合基因组分析突出 Covid-19 的潜在遗传风险因素”,作者:AI Hernandez Cordero、X. Li1、S. Milne、C. Yang、Y. Bossé、P. Joubert、W. Timens、M. Van den Berge ,D. Nickle、K. Hao 和 DD Sin,3 年 2021 月 XNUMX 日, ATS 2021 国际会议.
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