Dalam pertikaian yang semakin meningkat yang mendedahkan hubungan itu, antara institusi kerajaan Vatican telah secara rasmi menyuarakan kebimbangannya mengenai keputusan yang dibuat oleh pegawai Perancis dalam masalah penyingkiran biarawati yang memetik pelanggaran kebebasan beragama. Perselisihan global ini berpusing sekitar situasi Sabine de la Valette, Sister Marie Ferréol dan pengusirannya, daripada Sisters of the Holy Spirit Dominican.
Vatican, yang diwakili oleh Matteo Bruni, Pengarah Pejabat Akhbarnya telah secara rasmi mengakui bahawa ia mengendalikan perkara ini melalui cara. Satu komunikasi rasmi telah dihantar ke Kedutaan Perancis, di Vatican dalam isyarat yang menonjolkan keseriusan Vatican menganggap pencerobohan sistem undang-undang Perancis ke dalam perkara yang dianggapnya sebagai urusan agama dan dalaman Gereja Katolik semata-mata.
Pertikaian itu tercetus apabila Tribunal Lorient didakwa mengeluarkan keputusan, mengenai aspek agama Cik De la Valettes keluar daripada komuniti agamanya. Vatican telah menyatakan ketidaksetujuan terhadap keputusan ini membayangkan bahawa mereka dimaklumkan tentang peranan tribunal melalui liputan media daripada saluran formal yang membayangkan kerosakan dalam ketelusan atau komunikasi, antara pegawai Perancis dan Takhta Suci.
Kardinal Marc Ouellet, yang merupakan sebahagian daripada kes itu, sebagai Pengawas Kongregasi untuk Uskup dilaporkan tidak menerima sebarang notis daripada Tribunal Lorient berhubung isu itu. Bruni menyebut bahawa Kardinal Ouellet telah melakukan lawatan, ke institut itu sebagai sebahagian daripada tugasnya, yang mengakibatkan tindakan dimulakan terhadap Cik De la Valette yang akhirnya membawa kepada pemberhentian.
Vatican berpendapat bahawa jika Tribunal Lorient membuat keputusan, mengenai isu ini ia menimbulkan kebimbangan, tentang imuniti dan mungkin melanggar hak untuk beribadat secara bebas dan bergaul dengan orang lain. Hak-hak ini dilindungi oleh undang-undang, yang biasanya mengesahkan bahawa organisasi agama mempunyai hak untuk menguruskan hal mereka secara bebas tanpa campur tangan luar.
Peristiwa baru-baru ini telah mencetuskan perbincangan, tentang bagaimana sistem perundangan negara dan undang-undang agama bersilang dan peranan mahkamah dalam mengawal selia kumpulan agama. Penentang keputusan tribunal mencadangkan bahawa ia menetapkan piawaian untuk campur tangan dalam kebebasan beragama, yang boleh memberi kesan bukan sahaja kepada Gereja Katolik tetapi juga organisasi berasaskan agama lain yang mencari autonomi, daripada tekanan luar.
Apabila senario ini berlaku, ia membentangkan halangan undang-undang yang menggariskan perdebatan yang berterusan, mengenai menggariskan had antara kebebasan gereja dan bidang kuasa kerajaan dalam masyarakat moden. Hasil daripada perkara ini mungkin mempunyai pelbagai akibat untuk hubungan antara Perancis dan Vatican serta untuk topik yang lebih luas mengenai kebebasan beragama, di seluruh Eropah.
Seperti yang dikatakan oleh Massimo Introvigne dalam a artikel baru-baru: "nampaknya melanggar kebebasan beragama kini menjadi kejadian harian di Perancis".
