Hogyan olvassuk és értelmezzük az adatokat
Ha egy országra vonatkozó adatok egynél több forrásból állnak rendelkezésre, az az alapértelmezett forrás, amelyikben a legtöbb sorozat szerepel az elmúlt két hétben.
A legutóbbi jelentési hét adatait kizártuk, mivel előfordulhat, hogy hiányosak.
A kötet sorrendjének meghatározásához használt kategóriák a mintaválasztási útmutatón alapulnak Az ECDC technikai útmutatója a SARS-CoV-2 szekvenálásáról és iránymutatás a reprezentatív és célzott genomikus SARS-CoV-2 monitorozáshoz:
- ≥500 vagy ≥10%-a: 500 vagy több, vagy az összes szekvenált minta legalább 10%-a hetente; ha a mintákat véletlenszerűen választják ki, akkor lehetőség nyílik a trendek követésére és a változatok eloszlásának becslésére. A nagyobb számok növelnék a pontosságot, és lehetővé tennék a keringő vírusok kisebb hányadát képviselő variánsok kimutatását.
- 60-499: 60 felett, de 500 alatti szekvenált minta hetente. Ha a mintákat véletlenszerűen választják ki, lehetséges az összes keringő változat több mint 2.5%-át kitevő változat kimutatása és a trendek követése, de a változatok eloszlásának becslése pontatlan lenne.
- <60: Hetente 60 kiválasztott minta alatt egy adott változatnak az összes keringő vírus legalább 5%-át kellene kimutatni, ha a mintavételt véletlenszerűen és reprezentatív módon végzik. Ez azt jelenti, hogy a rendszer nem lesz képes észlelni a keringő, aggodalomra okot adó változatokat, mielőtt azok hatással lennének az általános járványügyi helyzetre.
A műszerfal használata:
Válassza ki a hét számát a térképek és a változateloszlási grafikon szűréséhez.
Válassza ki az országot mindkét grafikon szűréséhez.
A teljes irányítópult szűrhető úgy, hogy csak akkor jelenjen meg az adatok, ha a szekvenálási mennyiségek meghaladták az ECDC által ajánlottakat (>=500 sorozat vagy az esetek >=10%-a egy adott héten), ha rákattint a „források manuális konfigurálása” elemre, és használja a „forrás” ” szűrőt (jobbra fent) a forrásváltáshoz.
Korlátozások:
Mivel nem minden generált szekvenciát jelentenek, előfordulhat, hogy egyes országokban alulbecsülik a szekvenálási tevékenységeket. Kérjük, tekintse meg a országáttekintő jelentés további korlátozásokhoz.
A változatok aránya csak akkor megbízható, ha a szekvenálási kapacitás megfelelő (≥500 vagy ≥10%-a az összes mintának). Még ebben az esetben is óvatosan kell kezelni a becsléseket, mivel elfogultak lehetnek, ha a szekvenált vírusok nem reprezentatívak az ország összes esetére. A TESSy adatok esetében nem becsülték meg azon változatok arányát, ahol nem áll rendelkezésre megbízható nevező.
Háttér információk
A SARS-CoV-2 felfedezése óta három, aggodalomra okot adó változatot, amelyeket először az Egyesült Királyságban (B.1.1.7), Dél-Afrikában (B.1.351) és Brazíliában (P.1) azonosítottak, összefüggésbe hoztak a magasabb szintű fertőzésekkel. a betegség átvihetősége és súlyossága, ami potenciális hatással lehet a szerzett immunitásra vagy a jelenlegi vakcinák hatékonyságára. Ezenkívül a SARS-CoV-2 B.1.617.1, B.1.617.2 és B.1.617.3 törzseit, amelyeket először Indiában jelentettek be 2020 decemberében, más országokban is egyre gyakrabban észlelték.
