Issus d'une ancienne lignée, les loups indiens sont l'une des populations de loups gris les plus distinctes et les plus menacées sur le plan de l'évolution. Crédit : Mihir Godbole/The Grasslands Trust
Des scientifiques séquencent le génome du loup indien pour la première fois
- Le loup indien pourrait être beaucoup plus menacé qu'on ne le pensait auparavant, selon les premiers scientifiques à séquencer son génome
- Les loups indiens pourraient représenter la plus ancienne lignée de loups survivante
Le loup indien pourrait être beaucoup plus menacé qu'on ne le pensait auparavant, selon une étude de l'Université de Californie à Davis et des scientifiques qui ont séquencé le génome du loup indien pour la première fois.
Les résultats, publiés dans la revue Molecular Ecology, révèlent que le loup indien est l'une des populations de loups gris les plus menacées et les plus distinctes sur le plan de l'évolution. L'étude indique que les loups indiens pourraient représenter la plus ancienne lignée de loups encore en vie.
Le loup indien est limité aux basses terres de l'Inde et du Pakistan, où son habitat de prairie est principalement menacé par l'empiétement humain et la conversion des terres.
Loup indien. Crédit : Mihir Godbole/The Grasslands Trust
"Les loups sont l'un des derniers grands carnivores restants au Pakistan, et de nombreux grands carnivores indiens sont en voie de disparition", a déclaré l'auteur principal Lauren Hennelly, doctorante à l'unité de conservation de l'écologie des mammifères de l'UC Davis School of Veterinary Medicine. "J'espère que le fait de savoir qu'ils sont si uniques et que l'on ne les trouve que là-bas inspirera les populations locales et les scientifiques à en savoir plus sur la conservation de ces loups et de ces habitats de prairies."
"Un changement de jeu"
Les auteurs ont séquencé les génomes de quatre loups indiens et de deux loups tibétains et ont inclus 31 génomes de canidés supplémentaires pour résoudre leur histoire évolutive et phylogénomique. Ils ont découvert que les loups tibétains et indiens sont distincts les uns des autres et des autres populations de loups.
L'étude recommande que les populations de loups indiens et tibétains soient reconnues comme des unités importantes sur le plan de l'évolution, une désignation provisoire qui aiderait à prioriser leur conservation pendant que leur classification taxonomique est réévaluée.
Cette illustration d'un loup indien indique sa distribution actuellement reconnue par rapport à son clade évolutif distinct, soulignant à quel point sa population est probablement plus petite que prévu. Crédit : Illustration de Lauren Hennelly/UC Davis
"Cet article pourrait changer la donne pour que les espèces persistent dans ces paysages", a déclaré le co-auteur Bilal Habib, biologiste de la conservation au Wildlife Institute of India. "Les gens peuvent se rendre compte que l'espèce avec laquelle nous partageons le paysage est le loup le plus éloigné qui existe aujourd'hui."
Les populations de loups indiens et d'Asie occidentale sont actuellement considérées comme une seule population. La découverte de l'étude selon laquelle les loups indiens sont distincts des loups d'Asie occidentale indique que leur distribution est beaucoup plus petite qu'on ne le pensait auparavant.
Une ancienne lignée
Les loups gris sont l'un des mammifères terrestres les plus répandus au monde, trouvés dans la neige, les forêts, les déserts et les prairies de l'hémisphère nord. Les loups ont peut-être survécu aux périodes glaciaires dans des régions isolées appelées refuges, divergeant potentiellement en lignées évolutives distinctes.
Des études génomiques récentes ont confirmé que le loup tibétain est une lignée évolutive ancienne et distincte. Cependant, jusqu'à cette étude, ce que l'on savait de l'histoire de l'évolution des loups indiens était basé sur des données mitochondriales. L'ADN preuve, qui n'est héritée que de la mère. Cette preuve suggérait que le loup indien a divergé plus récemment que le loup tibétain.
Cette illustration indique les aires de répartition des populations de loups holarctiques, tibétains et indiens dans l'hémisphère nord. Crédit : illustration de Lauren Hennelly, UC Davis
En revanche, cette étude a utilisé le génome entier - l'ADN nucléaire contenant presque tous les gènes reflétant l'histoire évolutive du loup. Cela a montré que le loup indien était probablement encore plus divergent que le loup tibétain.
"Le séquençage mitochondrial seul n'était pas suffisant pour plaider la cause", a déclaré l'auteur principal Ben Sacks, directeur de l'unité de conservation des mammifères et de l'écologie à l'UC Davis. "L'ADN nucléaire est la grande image, et cela change l'image. Vous pourriez supposer que la plus grande diversité génétique des loups gris se trouve dans la région nord, où la plupart des loups se trouvent aujourd'hui. Mais ces populations du sud abritent l'essentiel de la diversité évolutive et sont aussi les plus menacées.
Les loups tibétains et indiens sont issus d'une ancienne lignée antérieure à la montée des loups holarctiques, trouvés en Amérique du Nord et en Eurasie. Sacks a déclaré que cette étude indique que les loups indiens pourraient représenter la plus ancienne lignée survivante.
Compétition charismatique
L'attention portée aux loups gris en Inde est souvent éclipsée par des animaux considérés comme plus charismatiques, comme les tigres, les lions et les léopards. Hennelly, qui rêvait d'être biologiste des loups en cinquième année, ne savait pas qu'il y avait des loups dans la région jusqu'à ce qu'elle mène des travaux sur le terrain sur les oiseaux de l'Himalaya. Lorsque l'opportunité d'étudier les hurlements et le comportement des loups en Inde s'est présentée en tant que boursière Fulbright, elle a sauté sur l'occasion et a commencé le travail et les collaborations qui ont conduit son équipe à devenir la première à séquencer le génome du loup indien.
Un loup indien hurle dans une prairie. Crédit : Mihir Godbole/The Grasslands Trust
"Je savais que si nous séquencions les loups et que les résultats indiquaient une lignée divergente, répondre à cette question pourrait vraiment aider leur conservation à une échelle politique qui pourrait se répercuter et renforcer les efforts locaux pour aider à protéger ces loups", a déclaré Hennelly.
Une étude distincte dirigé par Sacks sur les loups rouges en voie de disparition apparaît sur la couverture du même numéro d'écologie moléculaire en septembre. Abordant une controverse de 30 ans, cette étude montre que les loups rouges ne sont pas un hybride de l'ère coloniale entre les loups gris et les coyotes, comme certains l'ont soutenu, mais le descendant d'un loup nord-américain préhistorique qui a divergé des coyotes sur plus de 20,000 XNUMX ans. il y a des années. Les deux études ont des implications substantielles pour la conservation du loup.
Référence : « Ancienne divergence des loups indiens et tibétains révélée par la phylogénomique consciente de la recombinaison » par Lauren M. Hennelly, Bilal Habib, Shrushti Modi, Eli K. Rueness, Philippe Gaubert et Benjamin N. Sacks, 16 août 2021, Écologie moléculaire.
DOI : 10.1111/mec.16127
L'étude sur les loups indiens a été financée par le ministère des Sciences et de la Technologie de l'Inde, le Wildlife Institute of India, le UK Wolf Conservation Trust et l'UC Davis. Hennelly a également été soutenu par des bourses de recherche de la National Science Foundation et de l'UC Davis. L'étude sur le loup rouge a été financée par diverses sources, dont le US Fish and Wildlife Service.
